La Universidad de Coimbra alberga una auténtica joya, la Biblioteca Joanina que es una obra maestra del barroco europeo. Se construyó entre 1717 y 1728 y tiene 60.000 libros, algunos de ellos datan del siglo XII. Esta biblioteca tiene la ventaja de que por su construcción se mantienen en muy buen estado los libros. Los creadores de la película La Bella y la Bestia eligieron esta biblioteca para hacer una reprodución exacta para que fuera la biblioteca que tiene Bestia.
Debajo de la Universidad se encuentra una cárcel y es que la universidad tenía su propio sistema legislativo y si un alumno faltaba a clase o rompía algún libro, les metían en alguna de las celdas.